17_feature_importance_via_attention_weights

Feature Importance via the attention weights¶

I will start by saying that I consider this feature of the library purely experimental. First of all I think there are multiple ways one could address finding the features importances for these models. However, and more importantly, one has to bear in mind that even tree-based algorithms on the same dataset produce different feature importances. This is more "dramatic" if one uses different techniques, such as shap or feature permutation (see for example this and references therein). All this to say that, sometimes, feature importance is just a measure contained within the experiment run, and for the model used.

With that in mind, each instantiation of a deep tabular model, that has millions of trainable parameters, will potentially produce a different set of feature importances, even if the model has the same architecture. Moreover, this effect will become more apparent if the dataset is relatively easy and there are dependent/related columns so that one could get to the same success metric with different parameters.

In summary, feature importances are implemented in this librray for all attention-based models for tabular data, with the exception of the TabPerceiver. However this functionality has to be used and interpreted with care and consider of value within the 'universe' (or context) of the model with which these features were produced.

Nonetheless, let's have a look to how one would access to the feature importances when using this library.

In [1]:

import torch

import numpy as np
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.metrics import accuracy_score


from pytorch_widedeep import Trainer
from pytorch_widedeep.models import TabTransformer, ContextAttentionMLP, WideDeep
from pytorch_widedeep.callbacks import EarlyStopping
from pytorch_widedeep.metrics import Accuracy
from pytorch_widedeep.datasets import load_adult
from pytorch_widedeep.preprocessing import TabPreprocessor

import torch import numpy as np from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.metrics import accuracy_score from pytorch_widedeep import Trainer from pytorch_widedeep.models import TabTransformer, ContextAttentionMLP, WideDeep from pytorch_widedeep.callbacks import EarlyStopping from pytorch_widedeep.metrics import Accuracy from pytorch_widedeep.datasets import load_adult from pytorch_widedeep.preprocessing import TabPreprocessor

In [2]:

# use_cuda = torch.cuda.is_available()
df = load_adult(as_frame=True)
df.columns = [c.replace("-", "_") for c in df.columns]
df["income_label"] = (df["income"].apply(lambda x: ">50K" in x)).astype(int)
df.drop(["income", "fnlwgt", "educational_num"], axis=1, inplace=True)
target_colname = "income_label"

# use_cuda = torch.cuda.is_available() df = load_adult(as_frame=True) df.columns = [c.replace("-", "_") for c in df.columns] df["income_label"] = (df["income"].apply(lambda x: ">50K" in x)).astype(int) df.drop(["income", "fnlwgt", "educational_num"], axis=1, inplace=True) target_colname = "income_label"

In [3]:

df.head()

df.head()

Out[3]:

	age	workclass	education	marital_status	occupation	relationship	race	gender	capital_gain	capital_loss	hours_per_week	native_country	income_label
0	25	Private	11th	Never-married	Machine-op-inspct	Own-child	Black	Male	0	0	40	United-States	0
1	38	Private	HS-grad	Married-civ-spouse	Farming-fishing	Husband	White	Male	0	0	50	United-States	0
2	28	Local-gov	Assoc-acdm	Married-civ-spouse	Protective-serv	Husband	White	Male	0	0	40	United-States	1
3	44	Private	Some-college	Married-civ-spouse	Machine-op-inspct	Husband	Black	Male	7688	0	40	United-States	1
4	18	?	Some-college	Never-married	?	Own-child	White	Female	0	0	30	United-States	0

In [4]:

cat_embed_cols = []
for col in df.columns:
    if df[col].dtype == "O" or df[col].nunique() < 200 and col != target_colname:
        cat_embed_cols.append(col)

cat_embed_cols = [] for col in df.columns: if df[col].dtype == "O" or df[col].nunique() < 200 and col != target_colname: cat_embed_cols.append(col)

In [5]:

# all cols will be categorical
assert len(cat_embed_cols) == df.shape[1] - 1

# all cols will be categorical assert len(cat_embed_cols) == df.shape[1] - 1

In [6]:

train, test = train_test_split(
    df, test_size=0.1, random_state=1, stratify=df[[target_colname]]
)

train, test = train_test_split( df, test_size=0.1, random_state=1, stratify=df[[target_colname]] )

In [7]:

tab_preprocessor = TabPreprocessor(cat_embed_cols=cat_embed_cols, with_attention=True)

tab_preprocessor = TabPreprocessor(cat_embed_cols=cat_embed_cols, with_attention=True)

In [8]:

X_tab_train = tab_preprocessor.fit_transform(train)
X_tab_test = tab_preprocessor.transform(test)
target = train[target_colname].values

X_tab_train = tab_preprocessor.fit_transform(train) X_tab_test = tab_preprocessor.transform(test) target = train[target_colname].values

In [9]:

tab_transformer = TabTransformer(
    column_idx=tab_preprocessor.column_idx,
    cat_embed_input=tab_preprocessor.cat_embed_input,
    embed_continuous_method="standard",
    input_dim=8,
    n_heads=2,
    n_blocks=1,
    attn_dropout=0.1,
    transformer_activation="relu",
)

tab_transformer = TabTransformer( column_idx=tab_preprocessor.column_idx, cat_embed_input=tab_preprocessor.cat_embed_input, embed_continuous_method="standard", input_dim=8, n_heads=2, n_blocks=1, attn_dropout=0.1, transformer_activation="relu", )

In [10]:

model = WideDeep(deeptabular=tab_transformer)

model = WideDeep(deeptabular=tab_transformer)

In [11]:

optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=0.0)

optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=0.0)

In [12]:

lr_scheduler = torch.optim.lr_scheduler.ReduceLROnPlateau(
    optimizer,
    threshold=0.001,
    threshold_mode="abs",
    patience=10,
)

lr_scheduler = torch.optim.lr_scheduler.ReduceLROnPlateau( optimizer, threshold=0.001, threshold_mode="abs", patience=10, )

In [13]:

early_stopping = EarlyStopping(
    min_delta=0.001, patience=30, restore_best_weights=True, verbose=True
)

early_stopping = EarlyStopping( min_delta=0.001, patience=30, restore_best_weights=True, verbose=True )

In [14]:

trainer = Trainer(
    model,
    objective="binary",
    optimizers=optimizer,
    lr_schedulers=lr_scheduler,
    reducelronplateau_criterion="loss",
    callbacks=[early_stopping],
    metrics=[Accuracy],
)

trainer = Trainer( model, objective="binary", optimizers=optimizer, lr_schedulers=lr_scheduler, reducelronplateau_criterion="loss", callbacks=[early_stopping], metrics=[Accuracy], )

The feature importances will be computed after training, using a sample of the training dataset of size feature_importance_sample_size

In [15]:

trainer.fit(
    X_tab=X_tab_train,
    target=target,
    val_split=0.2,
    n_epochs=100,
    batch_size=128,
    validation_freq=1,
    feature_importance_sample_size=1000,
)

trainer.fit( X_tab=X_tab_train, target=target, val_split=0.2, n_epochs=100, batch_size=128, validation_freq=1, feature_importance_sample_size=1000, )

epoch 1: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 81.80it/s, loss=0.334, metrics={'acc': 0.847}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 111.34it/s, loss=0.294, metrics={'acc': 0.8669}]
epoch 2: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 83.02it/s, loss=0.293, metrics={'acc': 0.8656}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 124.03it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8678}]
epoch 3: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 87.69it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8703}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 118.22it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8717}]
epoch 4: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.24it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8718}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 115.29it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8731}]
epoch 5: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 83.76it/s, loss=0.275, metrics={'acc': 0.8727}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 120.80it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8727}]
epoch 6: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 82.78it/s, loss=0.273, metrics={'acc': 0.873}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 100.43it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.871}]
epoch 7: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.35it/s, loss=0.271, metrics={'acc': 0.8742}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 116.14it/s, loss=0.275, metrics={'acc': 0.8726}]
epoch 8: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 74.29it/s, loss=0.271, metrics={'acc': 0.875}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 117.46it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8718}]
epoch 9: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.10it/s, loss=0.27, metrics={'acc': 0.8761}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 105.49it/s, loss=0.275, metrics={'acc': 0.8728}]
epoch 10: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 70.40it/s, loss=0.269, metrics={'acc': 0.8747}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 105.47it/s, loss=0.275, metrics={'acc': 0.8726}]
epoch 11: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 72.83it/s, loss=0.268, metrics={'acc': 0.8742}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 105.03it/s, loss=0.274, metrics={'acc': 0.873}]
epoch 12: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 71.86it/s, loss=0.267, metrics={'acc': 0.8743}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 106.61it/s, loss=0.274, metrics={'acc': 0.8734}]
epoch 13: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 72.39it/s, loss=0.267, metrics={'acc': 0.876}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 108.05it/s, loss=0.275, metrics={'acc': 0.8717}]
epoch 14: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 73.36it/s, loss=0.265, metrics={'acc': 0.8767}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 109.60it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8747}]
epoch 15: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 73.34it/s, loss=0.264, metrics={'acc': 0.876}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 117.55it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8706}]
epoch 16: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.35it/s, loss=0.264, metrics={'acc': 0.8777}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 122.08it/s, loss=0.275, metrics={'acc': 0.8753}]
epoch 17: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.96it/s, loss=0.263, metrics={'acc': 0.877}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 120.83it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8739}]
epoch 18: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.38it/s, loss=0.263, metrics={'acc': 0.8779}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 118.18it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8714}]
epoch 19: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.61it/s, loss=0.261, metrics={'acc': 0.8784}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 119.19it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8712}]
epoch 20: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 72.43it/s, loss=0.261, metrics={'acc': 0.8791}]
valid: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 118.87it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.873}]
epoch 21: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 73.97it/s, loss=0.26, metrics={'acc': 0.8787}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 107.50it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8732}]
epoch 22: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 71.76it/s, loss=0.253, metrics={'acc': 0.8816}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 108.11it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8707}]
epoch 23: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 71.92it/s, loss=0.252, metrics={'acc': 0.8828}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 100.14it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8711}]
epoch 24: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.04it/s, loss=0.252, metrics={'acc': 0.8829}]
valid: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 98.36it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8708}]
epoch 25: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.31it/s, loss=0.251, metrics={'acc': 0.883}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 122.97it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.8709}]
epoch 26: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.63it/s, loss=0.25, metrics={'acc': 0.8834}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 123.07it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.8698}]
epoch 27: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 78.37it/s, loss=0.251, metrics={'acc': 0.884}]
valid: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 114.75it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.87}]
epoch 28: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.19it/s, loss=0.25, metrics={'acc': 0.883}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 117.99it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8699}]
epoch 29: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.19it/s, loss=0.25, metrics={'acc': 0.8829}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 111.11it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8695}]
epoch 30: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.57it/s, loss=0.249, metrics={'acc': 0.8839}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 115.64it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8689}]
epoch 31: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.55it/s, loss=0.249, metrics={'acc': 0.8846}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 125.10it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.869}]
epoch 32: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 82.56it/s, loss=0.248, metrics={'acc': 0.8841}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 118.45it/s, loss=0.284, metrics={'acc': 0.8687}]
epoch 33: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 81.06it/s, loss=0.248, metrics={'acc': 0.8848}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 129.26it/s, loss=0.284, metrics={'acc': 0.8689}]
epoch 34: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 80.53it/s, loss=0.248, metrics={'acc': 0.8854}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 120.61it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.869}]
epoch 35: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 80.78it/s, loss=0.248, metrics={'acc': 0.8853}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 127.31it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8694}]
epoch 36: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 82.51it/s, loss=0.248, metrics={'acc': 0.8863}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 125.94it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8693}]
epoch 37: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 81.35it/s, loss=0.247, metrics={'acc': 0.8844}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 126.77it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8692}]
epoch 38: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 80.62it/s, loss=0.248, metrics={'acc': 0.8837}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 116.62it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8692}]
epoch 39: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.82it/s, loss=0.248, metrics={'acc': 0.8842}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 123.64it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8695}]
epoch 40: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.86it/s, loss=0.247, metrics={'acc': 0.8855}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 120.34it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8692}]

Best Epoch: 10. Best val_loss: 0.27451
Restoring model weights from the end of the best epoch

In [16]:

trainer.feature_importance

trainer.feature_importance

Out[16]:

{'age': 0.09718182,
 'workclass': 0.090637445,
 'education': 0.08910798,
 'marital_status': 0.08971319,
 'occupation': 0.12546304,
 'relationship': 0.086381145,
 'race': 0.050686445,
 'gender': 0.05116429,
 'capital_gain': 0.08165918,
 'capital_loss': 0.07702667,
 'hours_per_week': 0.08205996,
 'native_country': 0.07891885}

In [17]:

preds = trainer.predict(X_tab=X_tab_test)

preds = trainer.predict(X_tab=X_tab_test)

predict: 100%|████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 39/39 [00:00<00:00, 199.63it/s]

In [18]:

accuracy_score(preds, test.income_label)

accuracy_score(preds, test.income_label)

Out[18]:

0.8685772773797339

In [19]:

test.reset_index(drop=True, inplace=True)

test.reset_index(drop=True, inplace=True)

In [20]:

test[test.income_label == 0].head(1)

test[test.income_label == 0].head(1)

Out[20]:

	age	workclass	education	marital_status	occupation	relationship	race	gender	capital_gain	capital_loss	hours_per_week	native_country	income_label
0	26	Private	Some-college	Never-married	Exec-managerial	Not-in-family	White	Male	0	0	60	United-States	0

In [21]:

test[test.income_label == 1].head(1)

test[test.income_label == 1].head(1)

Out[21]:

	age	workclass	education	marital_status	occupation	relationship	race	gender	capital_gain	capital_loss	hours_per_week	native_country	income_label
3	36	Local-gov	Doctorate	Married-civ-spouse	Prof-specialty	Husband	White	Male	0	1887	50	United-States	1

To get the feature importance of a test dataset, simply use the explain method

In [22]:

feat_imp_per_sample = trainer.explain(X_tab_test, save_step_masks=False)

feat_imp_per_sample = trainer.explain(X_tab_test, save_step_masks=False)

In [23]:

list(test.iloc[0].index[np.argsort(-feat_imp_per_sample[0])])

list(test.iloc[0].index[np.argsort(-feat_imp_per_sample[0])])

Out[23]:

['hours_per_week',
 'education',
 'relationship',
 'occupation',
 'workclass',
 'capital_gain',
 'native_country',
 'marital_status',
 'capital_loss',
 'age',
 'race',
 'gender']

In [24]:

list(test.iloc[3].index[np.argsort(-feat_imp_per_sample[3])])

list(test.iloc[3].index[np.argsort(-feat_imp_per_sample[3])])

Out[24]:

['age',
 'capital_loss',
 'hours_per_week',
 'marital_status',
 'native_country',
 'relationship',
 'race',
 'education',
 'occupation',
 'capital_gain',
 'gender',
 'workclass']

We could do the same with the ContextAttentionMLP

In [25]:

context_attn_mlp = ContextAttentionMLP(
    column_idx=tab_preprocessor.column_idx,
    cat_embed_input=tab_preprocessor.cat_embed_input,
    cat_embed_dropout=0.0,
    input_dim=16,
    attn_dropout=0.1,
    attn_activation="relu",
)

context_attn_mlp = ContextAttentionMLP( column_idx=tab_preprocessor.column_idx, cat_embed_input=tab_preprocessor.cat_embed_input, cat_embed_dropout=0.0, input_dim=16, attn_dropout=0.1, attn_activation="relu", )

In [26]:

mlp_model = WideDeep(deeptabular=context_attn_mlp)

mlp_model = WideDeep(deeptabular=context_attn_mlp)

In [27]:

mlp_optimizer = torch.optim.Adam(mlp_model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=0.0)

mlp_optimizer = torch.optim.Adam(mlp_model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=0.0)

In [28]:

mlp_lr_scheduler = torch.optim.lr_scheduler.ReduceLROnPlateau(
    mlp_optimizer,
    threshold=0.001,
    threshold_mode="abs",
    patience=10,
)

mlp_lr_scheduler = torch.optim.lr_scheduler.ReduceLROnPlateau( mlp_optimizer, threshold=0.001, threshold_mode="abs", patience=10, )

In [29]:

mlp_early_stopping = EarlyStopping(
    min_delta=0.001, patience=30, restore_best_weights=True, verbose=True
)

mlp_early_stopping = EarlyStopping( min_delta=0.001, patience=30, restore_best_weights=True, verbose=True )

In [30]:

mlp_trainer = Trainer(
    mlp_model,
    objective="binary",
    optimizers=mlp_optimizer,
    lr_schedulers=mlp_lr_scheduler,
    reducelronplateau_criterion="loss",
    callbacks=[mlp_early_stopping],
    metrics=[Accuracy],
)

mlp_trainer = Trainer( mlp_model, objective="binary", optimizers=mlp_optimizer, lr_schedulers=mlp_lr_scheduler, reducelronplateau_criterion="loss", callbacks=[mlp_early_stopping], metrics=[Accuracy], )

In [31]:

mlp_trainer.fit(
    X_tab=X_tab_train,
    target=target,
    val_split=0.2,
    n_epochs=100,
    batch_size=128,
    validation_freq=1,
    feature_importance_sample_size=1000,
)

mlp_trainer.fit( X_tab=X_tab_train, target=target, val_split=0.2, n_epochs=100, batch_size=128, validation_freq=1, feature_importance_sample_size=1000, )

epoch 1: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 73.11it/s, loss=0.405, metrics={'acc': 0.8094}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 119.26it/s, loss=0.309, metrics={'acc': 0.8583}]
epoch 2: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 71.70it/s, loss=0.332, metrics={'acc': 0.8447}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 116.36it/s, loss=0.293, metrics={'acc': 0.8646}]
epoch 3: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 78.42it/s, loss=0.319, metrics={'acc': 0.8505}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 118.05it/s, loss=0.293, metrics={'acc': 0.8654}]
epoch 4: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.00it/s, loss=0.312, metrics={'acc': 0.8554}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 116.49it/s, loss=0.291, metrics={'acc': 0.8661}]
epoch 5: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.50it/s, loss=0.308, metrics={'acc': 0.8583}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 120.48it/s, loss=0.287, metrics={'acc': 0.8669}]
epoch 6: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 80.84it/s, loss=0.303, metrics={'acc': 0.8605}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 128.70it/s, loss=0.288, metrics={'acc': 0.8673}]
epoch 7: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.93it/s, loss=0.301, metrics={'acc': 0.8597}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 121.47it/s, loss=0.298, metrics={'acc': 0.8628}]
epoch 8: 100%|████████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 80.56it/s, loss=0.3, metrics={'acc': 0.8592}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 119.84it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.8718}]
epoch 9: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.17it/s, loss=0.298, metrics={'acc': 0.8619}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 126.32it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8716}]
epoch 10: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 82.13it/s, loss=0.297, metrics={'acc': 0.8615}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 120.50it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.8718}]
epoch 11: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 82.54it/s, loss=0.293, metrics={'acc': 0.8641}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 122.57it/s, loss=0.284, metrics={'acc': 0.867}]
epoch 12: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 80.92it/s, loss=0.293, metrics={'acc': 0.863}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 126.42it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8701}]
epoch 13: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.61it/s, loss=0.293, metrics={'acc': 0.8635}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 117.56it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8719}]
epoch 14: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 74.92it/s, loss=0.29, metrics={'acc': 0.8633}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 112.06it/s, loss=0.286, metrics={'acc': 0.8669}]
epoch 15: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.83it/s, loss=0.291, metrics={'acc': 0.865}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 112.88it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8677}]
epoch 16: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.74it/s, loss=0.29, metrics={'acc': 0.8653}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 120.85it/s, loss=0.285, metrics={'acc': 0.8672}]
epoch 17: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.99it/s, loss=0.29, metrics={'acc': 0.865}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 113.53it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8681}]
epoch 18: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 71.22it/s, loss=0.288, metrics={'acc': 0.8651}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 112.89it/s, loss=0.288, metrics={'acc': 0.8676}]
epoch 19: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.85it/s, loss=0.29, metrics={'acc': 0.8661}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 114.26it/s, loss=0.284, metrics={'acc': 0.8662}]
epoch 20: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.80it/s, loss=0.289, metrics={'acc': 0.8661}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 119.44it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.8703}]
epoch 21: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.72it/s, loss=0.29, metrics={'acc': 0.8661}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 113.04it/s, loss=0.285, metrics={'acc': 0.8648}]
epoch 22: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 74.86it/s, loss=0.289, metrics={'acc': 0.8656}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 111.75it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8666}]
epoch 23: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.68it/s, loss=0.289, metrics={'acc': 0.8668}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 115.86it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8724}]
epoch 24: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.93it/s, loss=0.288, metrics={'acc': 0.8653}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 114.69it/s, loss=0.285, metrics={'acc': 0.8656}]
epoch 25: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.99it/s, loss=0.284, metrics={'acc': 0.8671}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 118.27it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8707}]
epoch 26: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.86it/s, loss=0.282, metrics={'acc': 0.8686}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 123.94it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8712}]
epoch 27: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.86it/s, loss=0.283, metrics={'acc': 0.8691}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 114.11it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8716}]
epoch 28: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.43it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.8696}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 114.64it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8712}]
epoch 29: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.39it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.8696}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 115.83it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.872}]
epoch 30: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 74.93it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8706}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 113.07it/s, loss=0.275, metrics={'acc': 0.8714}]
epoch 31: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.35it/s, loss=0.281, metrics={'acc': 0.8697}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 112.68it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.872}]
epoch 32: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.72it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8693}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 122.50it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8709}]
epoch 33: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.68it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8716}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 110.07it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8709}]
epoch 34: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 73.58it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8704}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 111.07it/s, loss=0.274, metrics={'acc': 0.8719}]
epoch 35: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 74.03it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8687}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 110.15it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.871}]
epoch 36: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 73.11it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8706}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 111.10it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8705}]
epoch 37: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 74.30it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.869}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 110.75it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8702}]
epoch 38: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 72.34it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8691}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 117.79it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8698}]
epoch 39: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.49it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8694}]
valid: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 115.25it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.87}]
epoch 40: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.51it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8694}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 110.90it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8694}]
epoch 41: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.35it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8716}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 115.74it/s, loss=0.28, metrics={'acc': 0.8675}]
epoch 42: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.35it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8695}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 122.76it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8699}]
epoch 43: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:04<00:00, 66.14it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8681}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 106.20it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8714}]
epoch 44: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 73.37it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8704}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 115.18it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8716}]
epoch 45: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.23it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8702}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 124.83it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8707}]
epoch 46: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.12it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8704}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 126.62it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8693}]
epoch 47: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 78.55it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8713}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 117.99it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8691}]
epoch 48: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.25it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8719}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 124.52it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8695}]
epoch 49: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 78.35it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8721}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 119.82it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8691}]
epoch 50: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.15it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8717}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 122.62it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8699}]
epoch 51: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 78.55it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8713}]
valid: 100%|███████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 117.63it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.87}]
epoch 52: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.04it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8721}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 126.39it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8697}]
epoch 53: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 78.15it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8721}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 127.56it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8699}]
epoch 54: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.41it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8711}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 118.95it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8698}]
epoch 55: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 76.35it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8718}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 126.90it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8699}]
epoch 56: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.83it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8707}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 115.13it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8691}]
epoch 57: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.20it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8722}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 123.16it/s, loss=0.279, metrics={'acc': 0.8691}]
epoch 58: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 73.33it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.871}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 123.37it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8691}]
epoch 59: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 78.41it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8714}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 125.17it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8695}]
epoch 60: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 79.26it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8721}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 120.60it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.869}]
epoch 61: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 75.88it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8703}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 124.47it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8692}]
epoch 62: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.13it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8711}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 125.80it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8691}]
epoch 63: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 77.20it/s, loss=0.277, metrics={'acc': 0.8715}]
valid: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 118.50it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.8695}]
epoch 64: 100%|█████████████████████████████████████████████████████████| 275/275 [00:03<00:00, 78.11it/s, loss=0.276, metrics={'acc': 0.8719}]
valid: 100%|██████████████████████████████████████████████████████████████| 69/69 [00:00<00:00, 114.52it/s, loss=0.278, metrics={'acc': 0.869}]

Best Epoch: 34. Best val_loss: 0.27449
Restoring model weights from the end of the best epoch

In [32]:

mlp_trainer.feature_importance

mlp_trainer.feature_importance

Out[32]:

{'age': 0.116632804,
 'workclass': 0.050255153,
 'education': 0.094621316,
 'marital_status': 0.12328919,
 'occupation': 0.107893184,
 'relationship': 0.11747801,
 'race': 0.054717205,
 'gender': 0.07514235,
 'capital_gain': 0.059732802,
 'capital_loss': 0.06738944,
 'hours_per_week': 0.0610674,
 'native_country': 0.07178114}

In [33]:

mlp_preds = mlp_trainer.predict(X_tab=X_tab_test)

mlp_preds = mlp_trainer.predict(X_tab=X_tab_test)

predict: 100%|████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 39/39 [00:00<00:00, 212.38it/s]

In [34]:

accuracy_score(mlp_preds, test.income_label)

accuracy_score(mlp_preds, test.income_label)

Out[34]:

0.8726714431934494